CrystalMaker X 化學分子建構軟體
- CrystalMaker X 化學分子建構軟體
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類別生化統計分析軟體
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介紹CrystalMaker X 是一個全新的程序,從頭開始為最新的 Mac 和 Windows 操作系統開發。每一行代碼都經過重新編寫,採用全新的面向對象架構、全新的基於 OpenGL 的圖形引擎、新的界面設計以及全新的、完全集成的結構庫。
CrystalMaker X chemical molecular construction software
State-of-the-Art
64-bit multi-processor, multi-touch, multi-structure application.
• Object-oriented design using native Cocoa (Mac) and
.NET (Windows) code.
• 64-bit precision used for all calculations and storage.
• Multi-processor design for improved performance.
• Drag-and-drop structures between windows.
Built for Mac
Genuine Mac application, written in Objective-C using Apple's native Cocoa frameworks. The results speak for themselves...
• Universal Binary: runs natively on Apple Silicon and Intel.
• Multi-touch rotation and zooming.
• Haptic feedback: feel the structure as you measure it!
• Retina display: gorgeous high-resolution graphics.
• Touch Bar interface for MacBook Pro: rotation dials, sliders,
contextual controls.
• Full-screen mode including "Spaces" support.
• Supports document tabs in macOS 10.12 "Sierra" and later
• Dedicated Touch Bar interface (MacBook Pro) with controls
for rotation, scaling, animation,structure building and measu
rement.
• Quick Look thumbnails and previews, including multi-
structure previews.
• Security-compliant sandboxed application: works with
system "Gatekeeper"to help keep your Mac safe from
malware and viruses.
Built for Windows
Genuine native 64-bit Windows application, written in C#
using Microsoft's latest .NET frameworks.
• Native Windows interface and system performance.
• High-resolution screen display (e.g., Microsoft Surface Pro).
• Multi-touch rotation and scaling (e.g., Microsoft Surface Pro).
• Code-signed application for extra security.
Beautiful New Interface
Maximises productivity in an elegant way.
• Integrated document window with Structures List, Inspector,
Output Log, Tool Strip, Legend and customizable window
To olbar.
• Library Browser with animations, structure rotation - and
a search command.
• Symmetry Explorer.
• Packing Explorer: design molecular crystals in real time.
• Vibrations Explorer: animate vibrational modes & IR
spectrum.
• Preferences window with Elements Explorer and
Periodic Table display.
Stunning Pixel-Perfect Graphics
Beautiful, fast Retina graphics - with transparency.
• Pixel-perfect OpenGL graphics. Complex intersections
between multiple objects (e.g., spheres and planes or
polyhedra) are accurately rendered.
• High-performance. Take advantage of graphics
acceleration on your computer's graphics card to
speed manipulation.
• Customizable reflectivity and up to 4 light sources.
• High-DPI "Retina" display on Mac (iMac and MacBook
/Pro with Retina display) and Windows (e.g., Microsoft
Surface Pro).
• Rich-text annotations with subscripts and superscripts.
Change fonts,colours, styles, sizes and baselines
(super/subscripts) within any annotation, for beautiful
captions and titles.
• Vector graphics output using PDF and EPS (Mac) or XPS
(Windows).
• Export high-resolution graphics with transparent
backgrounds.
TIFF and PNG files have the option of using a
transparent background.
Real-Time Editing
Inspectors make structure editing a breeze.
• Info Inspector displays rich-text notes plus
detailed structural information such as chemical
formula, numbers of visible atoms, symmetry, etc.
- which are updated on-the-fly.
• Atoms Inspector displays all of the atoms or
structural sites,grouped by chemical element
(or by molecule, or ungrouped, if required).
Clicking on the atom preview displays a popover
for editing sphere, ellipsoid or polyhedral styles.
Multiple rows in the can be selected to speed up
editing. A contextual menu
provides powerful commands, including automatic
colouring and the ability to switch between preset
atomic radii sets.
• Bonds Inspector combines bond specifications with
style control- and automatic labelling. Coordination
information is displayed on the right-hand side.
• Volume Inspector lets you manage multiple lattice planes
and volumetric datasets.
• Model & Rendering Inspectors let you adjust all
aspects of your model's display. Contextual menus
in each control group let you customize your preferences,
reset styles, or apply the current settings to all structures
in the document.
• Selection Inspector is displayed whenever one or more
objects (atoms, bonds, polyhedra, annotations, vectors)
are selected.Youcan simply point and click on an object,
then use the Inspector to edit the object's settings. The
Inspector changes, depending on what is selected.
Powerful "Actions" popup menus allow you to propagate
your changes to symmetry-related atoms or bonds, isolate
your selection,and much more.
• A new Cluster button, in the window toolbar, lets you edit
a spherical
cluster interactively: changing the centre point and its
minimum and maximum radii.
Multi-Structure Visualization
Save multiple structures in the same window to make rotatable animations,
interactive slideshows - or superimpose structures to create interfaces,domain boundaries or explore docking.
• Drag-and-drop structures between windows.
• Fast multi-structure animation.
• Compare differences between two or more structures
on screen.
• Create multi-structure crystal interfaces without having
to merge them.
• Multi-structure synchronization with atomistic-level control.
• Rotate animations in real time.
• Animation playback controls with "scrubber" bar for
rapidly scanning
through extended structure sequences/trajectories.
Flexible Bonding
Amazing new bond styles with secondary option for
saved distance measurements or to show inter-
molecular bonding.
• 14 stylized ("2D") and 10 photo-rendered ("3D") bond styles.
• Double-, triple-, segmented- and dotted-bonds.
• Primary or secondary bonds.
• Bond distance labels.
• Thin bond cylinder option.
New Sphere Styles
Pie chart, fuzzy and variable translucency.
• Visualize disordered or partial occupancy with
"Pie-chart" spheres: coloured or translucent sectors.
• "Fuzzy" sphere option with translucency.
• Slider control for sphere translucency.
• Defect symbols and emoji styles.
Powerful Polyhedra
Concave, curved, customizable.
• Concave polyhedra with curved faces.
• Ellipsoids in polyhedra.
• Control over polyhedral frame widths.
• Specify opacity for translucent styles.
• Control out-of-plane tolerance for many-vertex faces.
Multiple Lattice Planes
A litany of lattice planes in any orientation
•Multiple lattice planes.
• Parallel lattice plane sets.
• Display of symmetry-related planes.
• Automatic lattice slab generation.
New File Formats
CrystalMaker X can import data from 15 new formats:-
• 3ED Volumetric
• CASTEP Cell
• CASTEP Volumetric (chdiff_fmt, den_fmt, elf_fmt formats)
• CASTEP Output (includes all frames in the trajectory)
• Gaussian CUBE
• DEN volumetric
• DL_POLY Config and Revcon formats (plus existing
History import)
• Generic voxel (volumetric) data
• GRD volumetric data files
• GULP (loads input, output structures plus any
volumetric data)
• RMCprofile
• VASP Trajectory (XDATCAR)
• VASP Volumetric (ELK, CHK, CHGCAR)
• XCrySDen XSF
• XCrySDen AXSF
CrystalMaker X can export data to 6 new formats:-
• CASTEP Cell
• DL_POLY Config
• Generic voxel (volumetric) data
• GRD volumetric data files
• RMCprofile
• VASP
Packing Explorer
Turn any molecule into a molecular crystal - interactively.
• Interactive preview lets you rotate and scale the
proposed molecular crystal, change the number of
unit cells shown, and explore different model types
(e.g., switch between ball-and-stick or space-filling).
• Rotate the molecule relative to the unit cell axes.
• Change the position of the molecule within the unit cell.
• Edit symmetry - with real-time preview.
Symmetry Explorer
Browse symmetry relationships in 3D.
• Visualize general-equivalent positions in 3D, with cell
dividers and full rotation control.
• Space group popover, with preview.
• Slider controls to edit the general-equivalent position
(e.g., to move to a "special" position).
Volumetric Data
Combine your crystal structure(s) with multiple 3D datasets
in the same window - with gorgeous rendering.
• Work with multiple datasets in the same window.
• View 3ED, CASTEP, CUBE, DEN, GRD, GULP, VASP, Voxel data.
• Specify range limits as relative or absolute values.
• Real-time range slider with histogram preview.
• Mean, median, middle, mid-range or full-range presets.
• Iso-surfaces or volumes with colour or gradient display.
• Point clouds with variable size or colour gradient.
• Multiple lattice-plane slices, with translucency.
New Simulation Engine
Energy-based refinement for faster, accurate modelling.
• True energy-minimization algorithm (not just structure
optimization).
• Extensive new potentials library for a wide range of
bonding configurations.
• Two-stage process: Monte Carlo followed by Least
Squares for greater finesse.
Crystal Engineering
Collapse supercells, show twins, interpolate structures.
• New "Collapse Supercell" feature - ideal for
visualizing atomic disorder,especially with
the new Atomistic Density display.
• Reflect lattice to show twinning.
• Interpolate between any two selected structures,
or between all (unselected) structures. Specify
arbitrary number of interpolationlevels. Ideal for generating
smooth animations.
• Generate lattice slabs using a pair of lattice planes.
• Merge one selected structure into another.
Calculations
Calculate electron density, porosity, cavities and much more.
• Electron density maps for any crystal.
• Porosity value, or 3D porosity maps - visualize "
negative" (void) or "positive" (filled) space.
• Distance Map: ideal for working with cavity/
channel structures.
• Cavity Finder: with optional generation of
appropriately-sized cavity sites.
• D-Spacing Calculator.
• Van-der-Waals surface.
• Solvent-excluded surface with user-defined
probe-sphere radius.
• Molecular Centroids: simplifies complex
molecular crystals using dummy sites as
molecular proxies.
• Least-squares best-fit plane through points
(improves on previous versions of the
program to give consistent, accurate results).
• Best-fit line through points.
• Energy (molecule).
• Vibrational modes (molecule) - with
dynamical visualizations in the
Vibrations Explorer, video output and
option of text (eigenvectors etc.)
export.
• Infra-Red Spectrum (molecule) - with
customizable display (absorbance/
transmittance; increasing/decreasing x, etc.).
Integrated Structures Library
1200 annotated and searchable structures - with space for more.
• Reference collection with 1200 structures, including
400+ rock-forming minerals.
• Examples collection, showcasing the program's functionality.
• Teaching collection with crystal-chemical "type" structures.
• Thematic collection including food, fuel, energy materials.
• Browse recent files.
• Organise your own structures into custom folders.
• Automatic thumbnail generation for CIF and other text files.
• Search by title, notes, chemical formula.
• Interactive previews with auto-rotation and animation.
And so Much More...
Bond labels, rotatable measurements, legend...
• Colour-by-Molecule command.
• Legend. A key to the atoms in your structure, the Legend
can be dragged to different parts of the window or
hidden entirely.
• Preserve molecular coordinates as you rotate.
CrystalMaker provides
both screen coordinates and your original structural
coordinates.
• Flexible range generation: specify whatever range limits
you require,without them being reset (earlier versions of
the software required all range limits to start at the origin,
resetting negative values; the new program has no such
limitatins).
• Emphasize front cell edges. Sometimes it is difficult to
infer which edges are the front edges, and which are
the back. With the Emphasize Front Edges option in
the Model Inspector, the front edges are emphasized
with thicker lines than the back edges, thereby making
the cell orientation clearer.
• Coloured unit cell faces. Whilst the unit cell is generally
represented by its edges, you have the option of
displaying its faces in any colour and transparency.
• Selectable bonds. Simply click on any bond with the
Arrow tool and it will appear selected. The bond
properties are then displayed in the Selection
Inspector, for easy editing.
• Edit bond specifications from a selected bond. You
can edit the properties of any selected bond (in the Selection
Inspector) and then apply your changes to all bonds which
share the same bond specification. Alternatively, you can
select a bond and use the Selection Inspector's Show in
Bonds Inspector command to go directly to the
corresponding bond specification.
• Select symmetry-related bonds. The Selection Inspector
lets you take any selected bond and offers the option
of selecting all symmetry-related bonds.
• Selectable atom rows in the Atoms Inspector. One or
more rows can be selected(command-click to make
a discontinous selection) in the list; you can then use
the contextual menu to select the corresponding atoms
on the screen.
• Perspective grid. When perspective is in effect, the grid
changes to show the walls of a bounding box, emphasizing
how scale varies with depth.
• Atom search. You can search for an atom or site label in
the current structure.
If found, the corresponding row of the Atoms Inspector
is selected. You can also search for an individual atom
by entering its atom number in the search field.
If the atom is visible, it will be marked selected, and
its properties displayed in the Selection Inspector.
• Axial vectors can be dragged to different parts of the screen.
• Width and height of rectangular selection is displayed
when you click-and-drag with the Arrow tool.
• Add Title command: You can have a structure's name
automatically displayed as a new annotation object, using
this command from the Model menu. The title is displayed
in one of six positions in the graphics pane (which you can
customize using the Preferences panel). Holding down the
shift key adds titles to add structures in the Structures List:
invaluable when working with many frames from a simulation
or strucure sequence.
• Edit position and size of annotations by entering
numeric values in the Selection Inspector.
• Edit atom or site labels directly in the Atoms Inspector
(or Site Inspector),
without having to use the Crystal or Molecule editors.
• Separate Bond Angle & Torsion Angle tools. Owing to
public demand, we have reinstated the Torsion Angle
Tool as a separate tool in its own right.
(In CrystalMaker 9 this tool had been merged with
the Bond Angle tool.)
• Create bonds using the Distance Tool. When measuring
bond distances, a popup window allows creation of a
bond using the Distance Tool.
• Rotatable Distance & Angle Measurements. You can
now rotate and scale your structure without losing
your Bond Distance, Bond Angle or Torsion
Angle measurements.
• Add Atom Tool with live distance display. Holding
down the shift key when using the Add Atom tool
displays a labelled preview of the bond to be nserted
between the last-clicked atom to the current mouse position.
• Labelled Bond Distances. Bond distances can now be
preserved as "Distance
Measurements" (which are secondary bonds, displayed
with a dotted line style)
with the bond distance shown alongside.
• Smart "Bend Selection" command for nanotube generation;
removes overlapping atoms.
• New atom labelling options: x, y, z-coordinate; fractional
height.
• Online video tour.
系統需求
OS:
CrystalMaker 10 for Windows is distributed as a compressed Microsoft-Installer package, ready for auto-run.
• Windows 10 (recommended)
• Windows 8
• Windows 7
• 64-bit PC running Windows 7 or later.
• Graphics card with OpenGL 3.2 (or later) capability.
HD:
• 1 GB free disc space.
RAM:
• 4 GB RAM.
Mac
OS:
CrystalMaker 10.6 for Mac is a Universal Binary which runs
natively on Apple Silicon as well as older, Intel-based Macs.
As a bundled application all program resources, online help,
tutorial and user's guide are saved inside a single application
icon, making for easy drag-and-drop installation.
• macOS 11.x "Big Sur" (recommended)
• macOS 10.15 "Catalina"
• macOS 10.14 "Mojave"
• macOS 10.13 "High Sierra"
• macOS 10.12 "Sierra"
Apple Silicon or Intel Mac running macOS 10.12.2 "Sierra"or
later through to macOS 11.x "Big Sur"
HD:
• 1 GB free disc space.
RAM:
• 4 GB RAM.
CrystalMaker X 化學分子建構軟體
最先進的技術
64位元多處理器、多點觸控、多結構應用。
• 使用原生的 Cocoa (Mac) 和 .NET (Windows) 代碼的面向
對象設計。
• 64 位元精度用於所有計算和存儲。
• 多處理器設計以提高性能。
• 窗口之間的拖放結構。
專為 Mac 打造
真正的 Mac 應用程序,使用 Apple 的原生 Cocoa 框架用
Objective-C 編寫。結果不言自明...
• 通用二進制:在 Apple Silicon 和 Intel 上本地運行。
• 多點觸控旋轉和縮放。
• 觸覺反饋:在測量時感受結構!
• Retina 顯示屏:華麗的高分辨率圖形。
• MacBook Pro 的觸控欄界面:旋轉撥盤、滑塊、上下文控件。
• 全屏模式,包括“空格”支持。
• 支持 macOS 10.12 "Sierra" 及更高版本中的文檔標籤
• 專用觸控欄界面 (MacBook Pro),帶有旋轉、縮放、動畫、
結構構建和測量控件。
• 快速查看縮略圖和預覽,包括多結構預覽。
• 符合安全標準的沙盒應用程序:與系統“Gatekeeper”配合使用,
幫助您的 Mac 免受惡意軟件和病毒的侵害。
專為 Windows 打造
真正的原生 64 位 Windows 應用程序,使用 Microsoft 最新的 .NET 框架用 C# 編寫。
• 本機 Windows 界面和系統性能。
• 高分辨率屏幕顯示(例如,Microsoft Surface Pro)。
• 多點觸控旋轉和縮放(例如,Microsoft Surface Pro)。
• 代碼簽名的應用程序以提高安全性。
漂亮的新界面
以優雅的方式最大限度地提高生產力。
• 帶有結構列表、檢查器、輸出日誌、工具條、
圖例和可自定義窗口工具欄的集成文檔窗口。
• 帶有動畫、結構旋轉和搜索命令的庫瀏覽器。
• 對稱瀏覽器。
• Packing Explorer:實時設計分子晶體。
• 振動資源管理器:動畫振動模式和紅外光譜。
• 帶有元素資源管理器和周期表顯示的首選項窗口。
令人驚嘆的像素完美圖形
漂亮、快速的 Retina 圖形 - 具有透明度。
• 像素完美的 OpenGL 圖形。多個對象(例如,球體和平面或多面體)
之間的複雜交叉點被準確渲染。
• 高性能。利用計算機圖形卡上的圖形加速來加快操作速度。
• 可定制的反射率和多達 4 個光源。
• Mac(iMac 和配備 Retina 顯示屏的 MacBook/Pro)和
Windows (例如 Microsoft Surface Pro)上的高 DPI“Retina”
顯示屏。
• 帶有下標和上標的富文本註釋。更改任何註釋中的字體、顏色、
樣式、大小和基線(上標/下標)以獲得漂亮的標題和標題。
• 使用 PDF 和 EPS (Mac) 或 XPS (Windows) 輸出矢量圖形。
• 導出具有透明背景的高分辨率圖形。TIFF 和 PNG 文件可以
選擇使用透明背景。
即時編輯
檢查員使結構編輯變得輕而易舉。
• Info Inspector 顯示富文本註釋以及詳細的結構信息,
例如化學式、可見原子的數量、對稱性等 - 即時更新。
• AtomsInspector顯示所有原子或結構位點,按化學元素分組
(或按分子分組,或未分組,如果需要)。
單擊原子預覽會顯示一個用於編輯球體、橢圓體或多面體樣式的
彈出窗口。可以選擇多行以加快編輯速度。
上下文菜單提供了強大的命令,包括自動著色和在預設原子半徑
集之間切換的能力。
• Bonds Inspector 結合了債券規範和样式控制 - 以及自動貼標。
坐標信息顯示在右側。
• Volume Inspector 可讓您管理多個晶格平面和體積數據集。
• 模型和渲染檢查器可讓您調整模型顯示的所有方面。每個控制組
中的上下文菜單讓您可以自定義首選項、重置樣式或將當前設置
應用於文檔中的所有結構。
• 每當選擇一個或多個對象(原子、鍵、多面體、註釋、向量)時,
就會顯示選擇檢查器。您可以簡單地指向並單擊對象,然後使用檢
查器來編輯對象的設置。Inspector 會根據選擇的內容而變化。強
大的“操作”彈出菜單允許您將更改傳播到與對稱相關的原子或鍵,
隔離您的選擇等等。
• 窗口工具欄中的新集群按鈕可讓您以交互方式編輯球形集群:更改中
心點及其最小和最大半徑。
多結構可視化
在同一窗口中保存多個結構以製作可旋轉動畫、交互式幻燈片 - 或疊加結構以創建界面、域邊界或探索對接。
• 窗口之間的拖放結構。
• 快速的多結構動畫。
• 比較屏幕上兩個或多個結構之間的差異。
• 無需合併即可創建多結構晶體界面。
• 具有原子級控制的多結構同步。
• 實時旋轉動畫。
• 帶有“scrubber”欄的動畫播放控件,用於快速掃描
擴展結構序列/軌跡。
靈活的粘接
驚人的新鍵樣式,帶有用於保存距離測量或顯示分子間鍵合的輔助選項。
• 14 種程式化(“2D”)和 10 種照片渲染(“3D”)粘合樣式。
• 雙鍵、三鍵、分段鍵和點鍵。
• 主要或次要債券。
• 鍵距標籤。
• 薄鍵合滾筒選項。
新球體樣式
餅圖、模糊和可變半透明度。
• 使用“餅圖”球體可視化無序或部分佔用:彩色或半透明扇區。
• 半透明的“模糊”球體選項。
• 球體半透明的滑塊控件。
• 缺陷符號和表情符號樣式。
強大的多面體
凹面,彎曲,可定制。
• 具有曲面的凹多面體。
• 多面體中的橢圓體。
• 控制多面體框架寬度。
• 指定半透明樣式的不透明度。
• 控制多頂點面的平面外容差。
多個晶格平面
任意方向的一連串晶格平面
• 多個晶格平面。
• 平行晶格平面集。
• 顯示與對稱相關的平面。
• 自動格子板生成。
新文件格式
CrystalMaker X 可以從 15 種新格式導入數據:-
• 3ED 體積
• CASTEP單元
• CASTEP 體積(chdiff_fmt、den_fmt、elf_fmt 格式)
• CASTEP 輸出(包括軌跡中的所有幀)
• 高斯立方體
• DEN 體積
• DL_POLY 配置和 Revcon 格式(加上現有的歷史導入)
• 通用體素(體積)數據
• GRD 體積數據文件
• GULP(加載輸入、輸出結構以及任何體積數據)
• RMC簡介
• VASP 軌跡 (XDATCAR)
• VASP 體積(ELK、CHK、CHGCAR)
• XCrySDen XSF
• XCrySDen AXSF
CrystalMaker X 可以將數據導出為 6 種新格式:-
• CASTEP單元
• DL_POLY 配置
• 通用體素(體積)數據
• GRD 體積數據文件
• RMC簡介
• VASP
包裝瀏覽器
將任何分子變成分子晶體 - 交互。
• 交互式預覽可讓您旋轉和縮放建議的分子晶體,更改顯示的晶胞
數量,並探索不同的模型類型(例如,在球棒或空間填充之間切
換)。
• 相對於晶胞軸旋轉分子。
• 改變分子在晶胞內的位置。
• 編輯對稱性 - 實時預覽。
對稱瀏覽器
瀏覽 3D 中的對稱關係。
• 可視化 3D 中的一般等效位置,具有細胞分隔器和完全旋轉控制。
• 空間組彈出窗口,帶預覽。
• 滑塊控件以編輯一般等效位置(例如,移動到“特殊”位置)。
體積數據
在同一窗口中將您的晶體結構與多個 3D 數據集相結合 - 具有華麗的渲染。
• 在同一窗口中處理多個數據集。
• 查看 3ED、CASTEP、CUBE、DEN、GRD、GULP、
VASP、體素數據。
• 將範圍限制指定為相對值或絕對值。
• 帶有直方圖預覽的實時範圍滑塊。
• 均值、中值、中值、中檔或全檔預設。
• 具有顏色或漸變顯示的等值面或體積。
• 具有可變大小或顏色漸變的點雲。
• 多個晶格平面切片,具有半透明性。
新的模擬引擎
基於能量的改進可實現更快、更準確的建模。
• 真正的能量最小化算法(不僅僅是結構優化)。
• 適用於各種鍵合配置的廣泛的新電位庫。
• 兩階段過程:Monte Carlo 之後是最小二乘法以獲得更好的技巧。
晶體工程
折疊超胞,顯示雙胞胎,插入結構。
• 新的“折疊超級單元”功能 - 非常適合可視化原子無序,
尤其是新的原子密度顯示。
• 反射晶格以顯示孿晶。
• 在任意兩個選定結構之間或所有(未選定)結構之間進行插值。
指定任意數量的插值級別。非常適合生成流暢的動畫。
• 使用一對晶格平面生成晶格板。
• 將一個選定的結構合併到另一個結構中。
計算
計算電子密度、孔隙率、空穴等。
• 任何晶體的電子密度圖。
• 孔隙度值或 3D 孔隙度圖 - 可視化“負”(空隙)或“正”(填充)
空間。
• 距離圖:非常適合處理腔體/通道結構。
• 腔體查找器:可選擇生成適當大小的腔體位置。
• D-間距計算器。
• 范德瓦爾斯曲面。
• 具有用戶定義的探針球半徑的無溶劑表面。
• 分子質心:使用虛擬位點作為分子代理來簡化複雜的分子晶體。
• 通過點的最小二乘最佳擬合平面(改進了以前版本的程序以提供
一致、準確的結果)。
• 通過點的最佳擬合線。
• 能量(分子)。
• 振動模式(分子) - 在振動資源管理器中具有動態可視化、
視頻輸出和文本(特徵向量等)導出選項。
• 紅外光譜(分子) - 具有可定制的顯示(吸光度/透射率;
增加/減少 x 等)。
集成結構庫
1200 個帶註釋和可搜索的結構 - 有更多空間。
• 包含 1200 個結構的參考集合,包括 400 多種造岩礦物。
• 示例集合,展示程序的功能。
• 具有晶體化學“類型”結構的教學集。
• 主題收藏包括食品、燃料、能源材料。
• 瀏覽最近的文件。
• 將您自己的結構組織到自定義文件夾中。
• CIF 和其他文本文件的自動縮略圖生成。
• 按標題、註釋、化學式搜索。
• 帶有自動旋轉和動畫的交互式預覽。
還有更多...
債券標籤、可旋轉測量、圖例...
• 按分子顏色命令。
• 傳奇。作為結構中原子的關鍵,圖例可以拖動到窗口的
不同部分或完全隱藏。
• 旋轉時保留分子坐標。CrystalMaker 提供屏幕坐標和原始結構坐標。
• 靈活的範圍生成:指定您需要的任何範圍限制,而無需重置它們
(早期版本的軟件要求所有範圍限制從原點開始,重置負值;
新程序沒有此類限制)。
• 強調前面的單元格邊緣。有時很難推斷哪些邊緣是前邊緣,
哪些是後邊緣。
使用模型檢查器中的“強調前邊緣”選項,前邊緣會用比後邊緣
更粗的線條來強調,從而使單元格方向更清晰。
• 彩色晶胞面。雖然晶胞通常由其邊緣表示,但您可以選擇以任何
顏色和透明度顯示其面。
• 可選擇的債券。只需使用箭頭工具單擊任何鍵,
它就會顯示為選中狀態。然後鍵屬性會顯示在選擇檢查器中,
以便於編輯。
• 從選定的債券編輯債券規範。您可以編輯任何選定債券的屬性
(在選擇檢查器中),然後將更改應用於共享相同債券規格的
所有債券。或者,您可以選擇一個鍵並使用選擇檢查器的
Show in Bonds Inspector 命令直接轉到相應的鍵規範。
• 選擇與對稱相關的鍵。選擇檢查器讓您可以選擇任何選定的債券,
並提供選擇所有對稱相關債券的選項。
• 原子檢查器中的可選原子行。可以在列表中選擇一行或多行
(命令單擊以進行不連續的選擇);然後您可以使用上下文菜單在
屏幕上選擇相應的原子。
• 透視網格。當透視生效時,網格會發生變化以顯示邊界框的牆壁,
強調縮放如何隨深度變化。
• 原子搜索。您可以在當前結構中搜索原子或位點標籤。如果找到,
則選擇 Atoms Inspecto 的相應行。您還可以通過在搜索字段中
輸入原子編號來搜索單個原子。如果原子可見,它將被標記為選中,
並且其屬性顯示在選擇檢查器中。
• 軸向矢量可以拖動到屏幕的不同部分。
• 當您使用箭頭工具單擊並拖動時,將顯示矩形選擇的寬度和高度。
• 添加標題命令:您可以使用模型菜單中的此命令將結構名稱自動
顯示為新的註釋對象。標題顯示在圖形窗格中的六個位置之一
(您可以使用首選項面板自定義)。按住 shift 鍵添加標題以在結構
列表中添加結構:在處理來自模擬或結構序列的許多幀時非常有用。
• 通過在選擇檢查器中輸入數值來編輯註釋的位置和大小。
• 直接在 Atoms Inspector(或 Site Inspector)中編輯原子或站點
標籤,而無需使用 Crystal 或 Molecule 編輯器。
• 單獨的接合角和扭轉角工具。由於公眾的需求,我們已將扭轉角工具
恢復為獨立的工具。(在 CrystalMaker 9 中,此工具已與鍵角工具
合併。)
• 使用距離工具創建鍵。測量鍵距離時,彈出窗口允許使用距離工具創
建鍵。
• 可旋轉距離和角度測量。您現在可以旋轉和縮放結構而不會丟失鍵
距、鍵角或扭轉角測量值。
• 添加具有實時距離顯示的原子工具。使用 Add Atom 工具時按住
shift 鍵會顯示要在最後單擊的原子和當前鼠標位置之間插入的鍵
的標記預覽。
• 標記的鍵距離。鍵距離現在可以保留為“距離測量”(這是次鍵,
以虛線樣式顯示),鍵距離顯示在旁邊。
• 用於納米管生成的智能“彎曲選擇”命令;去除重疊的原子。
• 新的原子標記選項:x、y、z 坐標;分數高度。
MOPAC2016™ 量子化學軟體
MOPAC2016™是MOPAC2012™的後繼者,對大型生物大分子的建模方法進行了改進。 MOPAC2016™是一個半經驗量子化學軟件包,用於預測化學性質和建立化學反應模型。它被化學家和生物化學家用於研究和教學,並在Windows®、Linux和Macintosh平台上運行。
Molpro 2021 量子化學計算軟體
Molpro 是由H.-J設計和維護的用於高級分子電子結構計算的從頭算程序的綜合系統。Werner 和 PJ Knowles,並包含許多其他作者的貢獻 . 它包括用於標準計算化學應用的高效且並行化的程序,例如具有大量泛函選擇的 DFT,以及最先進的高級耦合簇和多參考波函數方法。電子激發態可以使用 MCSCF/CASSCF、CASPT2、MRCI 或 FCI 方法或響應方法(如 TDDFT、CC2 和 EOM-CCSD)進行處理。有許多模塊用於計算分子特性、幾何優化、諧波和非諧波振動頻率的計算以及進一步的波函數分析。分析能量梯度可用於 DFT、HF、MP2、MP2-F12、CCSD、CCSD-F12、DCSD、QCISD、QCISD(T)、CASSCF 和 CASPT2。密度擬合(DF 或 RI)近似可以將 DFT 和 MP2 計算加速到數量級的大基組,和明確相關的方法 [MP2-F12, CCSD(T)-F12, CASPT2-F12, MRCI-F12] 最小化基組不完整性誤差,以使用三重 zeta 基組產生接近 CBS 質量的結果。結合局部近似和高效並行化,高級方法 [PNO-LMP2-F12、PNO-LCCSD(T)-F12] 可應用於化學感興趣的大分子,產生前所未有的準確性(最近的評論見WIREs Comput Mol Sci
ADF 2020 量子化學軟體
ADF(阿姆斯特丹密度泛函數,Amsterdam Density Functional)是用於計算氣相或溶液環境中的原子和分子的 Fortran 程序。它可用於各種領域的研究,如分子光譜,有機和無機和化學,晶體學和藥物化學。ADF 軟體套件中的BAND程式是用於研究周期體系:晶體,表面,以及聚合物。