Diamond 4 分子結構軟體
- Diamond 4 分子結構軟體
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類別生化統計分析軟體
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介紹Diamond是傑出的分子和晶體結構顯示軟體.它結合了多種功能，可以用於含有晶體結構數據的工作，適用於教育，科學研究以及出版。Diamond像其它的軟體一樣不僅可以畫出精密的分子和晶體結構圖片，它還有一系列拓展的功能，它可以讓你很容易的從一套基本結構參數（晶胞，空間群和原子的位置）中模擬任意部分的晶體結構。
Diamond 4 分子結構軟體
自動和批量結構圖片創建
• “自動圖片創建器”對接窗格自動將建築選項、圖片設計和
查看方向的更改直接應用於結構圖片。
• “設計方案”（樣式表）的定義和應用。
• 增強的自動結構圖創建。
• “構建方案”（在鑽石 3 中稱為“自動構建”）和“圖片創建助手
”擴展為包裝圖，以及接觸和 H 鍵選項。
提高生產力
• “抓取模式”：在探索晶體或分子結構過程中更直觀的旋轉、
移動或縮放的新模式 。
• 鼠標光標下原子（鍵、分子）周圍原子和分子的相鄰預覽
• 使用鼠標滾輪更改屬性（放大係數、放大/縮小、更改原子
半徑）或更改環境（炸毀多面體、擴展分子簇等）的幾個
選項。
• 改進了對鍵合球體的評估（連接性）。
• “原子環境”作為填充配位球或添加配位多面體時的附加
（可選）標準。
• 基於狄利克雷域（Voronoi 多面體）確定原子位點環境。
• 支持無序部分以避免不同部分的原子之間出現不必要的連接。
• 結構圖繪製加速。抗鋸齒。
• 改進了從結構圖中選擇對象（加法/減法選擇）。
• 對像類型的選擇過濾器，以避免無意中匹配錯誤的對象。
• 原子設計可以分配給單個站點（而不是僅分配給原子組）。
• 混合站點組件的隨機分佈（參見“原子組和站點設計”對話
框）。
分子和聚合物的擴展功能
• 堆積圖：創建的幾個選項（細胞範圍、球體、平板或分子切 片）以及包含分子的距離。
• 連接對話框：定義非鍵合接觸和改進 H 鍵處理的附加頁面。
• 連接參數，通常從 CIF 中的“_geom_bond_xxx”、“_geom
_contact_xxx”和“_geom_hbond_xxx”循環導入。
• 改進了完成分子片段的功能。生成（對稱等效）分子的新對
話框。
• 在原子或分子附近搜索分子。
• 擴大或減少分子簇。
• 逐步生長或切割分子片段或聚合物（即：逐個球體）。
• 在選定的原子周圍泵起或收縮多個配位球（特別是對於聚
合物）。
新的多面體函數
• “原子環境”作為定義配位多面體原子的新可選標準。
• 原子或鍵的增強結構。
• 通過單擊組合或拆分多面體面。
• 在同一位置的原子之間複製和粘貼多面體。
• 創建 Voronoi 多面體。
搜索結構數據
• 訪問晶體結構數據庫COD（“晶體學開放數據庫”），
包括（除其他外）AMCSD（“美國礦物學家晶體結構
數據庫”） 以及來自 IUCr 期刊的CIF 文件。
• 最常見（無機）結構類型的小型數據庫，例如插入數據
或隨時可用的結構圖片。
• 改進了對硬盤上 Diamond 文檔和結構文件的搜索。
改進的用戶界面
• 更好地整合和關聯不同的視圖（結構圖、表格、粉末圖案 等）。
• 在多圖片文檔中與其他圖片的縮略圖並排編輯結構圖片。
• 增強了預覽、調整大小和排列結構圖片縮略圖的可能性。
• 結構參數集的顏色編碼。
• 粉末圖案、數據表（簡要或全面）和結構圖片下方的距離表， 具有增強的相關性（例如，結構圖片中當前選擇的原子周圍
的距離）。
• 可配置的數據表。
• “原子列表”：原子組、原子位點和創建的原子結構圖的分層
列表，例如編輯屬性和設計或從中選擇。
• 創建的分子（或片段）以及鍵、H 鍵和接觸參數的新表。
• 原子參數對話框，帶有類似報告的原子表示（可以按位點分 組），其中的項目可以直接在報告中編輯。
• “最近的圖片”：訪問最新查看和/或編輯過的結構圖片
- 來自當前和較早的 Diamond 會議。
• “撤消緩衝區”：現在可以通過多個步驟一起完成撤消/重做，
並輔以先前條件的縮略圖 。
• 結構圖全屏查看。
特殊功能
• 改進記錄結構圖片以創建視頻序列。
• 動畫 POV-Ray 圖片或來自 POV-Ray 圖片的視頻序列。
• 將結構圖導出為 Wavefront OBJ 和 STL 格式的 3D 模型。
• 帶有新聞頻道和最近查看的結構圖片縮略圖的起始頁。
• 用戶定義的對稱性。對稱元素的可視化。
• 鍵價。
• 根據結構圖中當前存在的原子，使用德拜公式計算粉末圖案
的可選計算。
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